微生物饲料是以微生物、复合酶为生物饲料发酵剂菌种，将饲料原料转化为微生物菌体蛋白、生物活性小肽类氨基酸、微生物活性益生菌、复合酶制剂为一体生物发酵饲料。该产品不但可以弥补常规饲料中容易缺乏的氨基酸，而且能使其它粗饲料原料营养成份迅速转化，达到增强消化吸收利用效果。

常用菌种

1、枯草芽孢杆菌

枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis），是芽孢杆菌属的一种，CAS号68038-70-0。单个细胞0.7～0.8×2～3微米，着色均匀。无荚膜，周生鞭毛，能运动。革兰氏阳性菌，可形成内生抗逆芽孢，芽孢0.6～0.9×1.0～1.5微米，椭圆到柱状，位于菌体中央或稍偏，芽孢形成后菌体不膨大。生长、繁殖速度较快，菌落表面粗糙不透明，污白色或微黄色，在液体培养基中生长时，常形成皱醭，是一种需氧菌。

可利用蛋白质、多种糖及淀粉，分解色氨酸形成吲哚。在遗传学研究中应用广泛，对此菌的嘌呤核苷酸的合成途径与其调节机制研究较清楚。广泛分布在土壤及腐败的有机物中，易在枯草浸汁中繁殖，故名。

有的菌株是α-淀粉酶和中性蛋白酶的重要生产菌；有的菌株具有强烈降解核苷酸的酶系，故常作选育核苷生产菌的亲株或制取5'-核苷酸酶的菌种。

2、地衣芽孢杆菌

地衣芽孢杆菌细胞形态和排列呈杆状、单生，可调整菌群失调达到治疗目的，可促使机体产生抗菌活性物质、杀灭致病菌。能产生抗活性物质，并具有独特的生物夺氧作用机制，能抑制致病菌的生长繁殖。

地衣芽孢杆菌（学名：Bacillus licheniformis）是一种在土壤中常见的革兰氏阳性嗜热细菌。在鸟类，特别是居住在地面的鸟类（如雀科）和水生的鸟类（如鸭）的羽毛中也能找到这种细菌，特别是在其胸部和背部的羽毛中。酶分泌的最适温度为37℃。它可能以孢子形式存在，从而抵抗恶劣的环境；在良好环境下，则可以生长态存在。该细菌可调整菌群失调达到治疗目的，可促使机体产生抗菌活性物质、杀灭致病菌。能产生抗活性物质，并具有独特的生物夺氧作用机制，能抑制致病菌的生长繁殖。

3、酿酒酵母菌

酿酒酵母菌属于酵母菌科，是一种单细胞生物，成卵圆型或球型，繁殖方式为出芽繁殖，孢子繁殖，接合繁殖三种，形态简单但生理复杂，工业上用于酿酒。酵母菌形态虽然简单，但生理却比较复杂，种类也比较多，应用也是多方面的。在工业上用于酿酒，酵母菌将葡萄糖、果糖、甘露糖等单糖吸入细胞内，在无氧的条件下，经过内酶的作用，把单糖分解为二氧化碳和酒精。此作用即发酵。在医药上，因酵母菌富含维生素B、蛋白质和多种酶，菌体可制成酵母片。治疗消化不良，并可从酵母菌中提取生产核酸类衍生物、辅酶A、细胞色素C、谷胱甘肽和多种氨基酸的原料。

4、乳酸菌

乳酸菌（lactic acid bacteria，LAB）是一类能利用可发酵碳水化合物产生大量乳酸的细菌的统称。这类细菌在自然界分布极为广泛，具有丰富的物种多样性，至少包含18个属，共200多种。除极少数外，其绝大部分都是人体内必不可少的、且具有重要生理功能的菌群，广泛存在于人体的肠道中。 乳酸菌不仅是研究分类、生化、遗传、分子生物学和基因工程的理想材料（在理论上具有重要的学术价值），而且在工业、农牧业、食品和医药等与人类生活密切相关的重要领域具有极高的应用价值。乳酸菌通过发酵产生的有机酸、特殊酶系、酸菌素等物质具有特殊生理功能。大量研究资料表明，乳酸菌能促进动物生长，调节胃肠道正常菌群、维持微生态平衡，从而改善胃肠道功能、提高食物消化率和生物效价、降低血清胆固醇、控制内毒素、抑制肠道内腐败菌生长、提高机体免疫力等。

5、双岐杆菌

双歧杆菌（Bifidobacterium）是从母乳营养儿的粪便中分离出的一种厌氧的革兰氏阳性杆菌，末端常常分叉，故名双歧杆菌。双歧杆菌有32个亚型，含有双歧杆菌的生物制剂多达70种。双歧杆菌是形态很不一致的杆菌，0.5～1.3 μm×1.5～8μm，常呈弯、棒状和分支状。单生、成对、V字排列，有时成链，细胞平行成栅栏状，或玫瑰花结状。偶尔呈膨大的球杆状。

生物屏障与生物拮抗作用

双歧杆菌属的细胞壁与肠黏膜上皮细胞相互作用密切结合, 与其他厌氧菌一起共同占据肠黏膜表面, 形成一道具有保护作用的生物屏障, 并通过自身及产生的代谢产物排斥致病菌, 在肠道中保持菌种优势, 并与其他菌群相互作用, 调整菌群间的关系, 以保证肠道菌群更佳组合,并维持肠道功能的平衡。其抗菌机制主要有:(1)产生有机酸, 能明显降低环境中的pH 值, 使不耐酸的腐败菌和致病菌的生长繁殖受到抑制。(2)产生类似细菌素的蛋白质, 有一定的杀菌作用。(3)产生H2O2 ,从而激活机体产生过氧化氢酶, 抑制和杀灭革兰阴性菌, 如志贺菌属和沙门菌属, 此外, 双歧杆菌属能分沁胞外糖苷酶, 可降解肠黏膜上皮细胞的复杂多糖, 以减少致病菌代谢的能源。

营养作用

双歧杆菌属能合成多种维生素,如B1 、B2 、B6 、叶酸、泛酸和B12 等, 当肠道菌群失调时, 明显表现为维生素缺乏, 从而证实了肠道菌群特别是占优势的双歧杆菌属为机体提供各种维生素的重要意义。双歧杆菌属还可以改善蛋白质的代谢,如产生的磷蛋白磷酸酶可将乳汁中α-酪蛋白降解,有益于乳蛋白的吸收, 在人体肠道内可产生β-半乳糖苷酶, 促进机体对乳糖的消化吸收。此外, 还可促进某些营养物质的吸收, 这是因为双歧杆菌属与其他厌氧菌产生的酸, 乙酸和乳酸, 使环境pH 下降,有利二价铁、维生素D 及钙的吸收。

免疫作用

正常人服用双歧杆菌属制剂后,红细胞免疫黏附功能增强, 可能与C36 受体数量增多及免疫黏附调节因子增强有关。它能激活机体吞噬活性, 提高抗感染能力。

降血脂作用

双歧杆菌属的结合胆汁酸水解酶能将各种结合胆汁酸水解为游离胆汁酸, 而游离胆汁酸与胆固醇在肠道共沉淀并从大便排出, 使血清胆固醇降低。

抗放射线作用

双歧杆菌属能够提高宿主对放射线的耐受性, 有实验研究表明, 用射线照射无菌小鼠后两周, 惟有与双歧杆菌属单联的小鼠存活时间比未联菌的小鼠长。

抗衰老作用

双歧杆菌属菌体成分或代谢产物具有抗胆固醇功能, 能明显减少肠管对胆固醇的吸收, 同时促进胆固醇转变为胆酸盐, 从而加快其排出体外, 对延缓机体衰老有积极作用。用其活菌液喂养老龄大鼠, 结果表明, 双歧杆菌属能使大鼠的某些具有抗衰老作用的酶SOD 、GSH-PX 活性升高, 而使大鼠衰老的物质LPO 浓度降低, 可见, 其具有一定的延缓动物衰老的作用。

6、醋酸菌

醋酸菌是重要的工业用菌之一。醋酸菌的细胞为椭圆至杆状；单个、成对或成链；端毛或周毛；运动或不运动；革兰氏阴性；专性好氧菌，氧化各种有机物成有机酸及其它种氧化物。一般在乙醇或其它可氧化物的酵母煮液或酵母消化液培养基上生长旺盛。

醋酸杆菌属的重要的特征是能将乙醇氧化成醋酸，并可将醋酸和乳酸氧化成CO2和H2O。有些菌株能够合成纤维素，其纤维素组成细胞壁外的基质，而细菌则埋置于纤维索微丝缠结的片层中。当这些种的细菌生长在静止的液体培养基中，它们就会在表面形成一层纤维素薄膜。

醋酸菌是一种原核生物，以二分裂的形式用来增殖。自然界中的醋酸菌分布广泛，在果园的土壤中、葡萄或酸败食物表面以及未灭菌的醋、果酒和啤酒中都有生长。代谢类型属于异养需氧型，故在发酵过程中一直需要氧气的参与。醋酸菌在发酵工程中常用来酿醋。

7、根霉菌

根霉的用途很广，其淀粉酶活力很强，能产生乳酸、反丁烯二酸、琥珀酸及微量酒精，还能产生芳香的酯类物质。食用甜酒药及糖化饲料就是选用此菌制备的。已知的根霉有多种，由土壤及五谷分离出来的根霉菌的糖化力远不及酒药中分离出的活力强。在酿造上根霉扮演着重要角色。我国小曲酒，是以根霉为主的霉菌类为糖化剂。根霉菌在生命活动中能产生糖化酶，将淀粉转化成糖，所以它是酿酒工业的糖化菌。根霉菌还可以处理造纸污泥生产乳酸，以及生产富马酸。

8、光合菌

光合菌是一种营养丰富、营养价值高的细菌，菌体含有丰富的氨基酸、叶酸、b族维生素，尤其是维生素b12和生物素含量较高，还有生理活性物质辅酶Q。光合菌的体积为小球藻的二十分之一，特别适合作为刚孵出仔鱼的开口饵料。使用光合菌作为开口饵料，可大幅度提高鱼苗成活率。光合菌还可作为饲料添加剂添加在饲料中，光合菌所含的酶类，可以促进鱼类对饲料的消化吸收，提高饲料利用率，降低饵料系数，同时还可显著提高鱼的生长速度。